Si tratta di analisi che mirano a stabilire il numero e/o la presenza di specifiche popolazioni microbiche (in particolare di batteri detti “indicatori”) e/o di uno specifico microrganismo in un alimento. Le analisi microbiologiche degli alimenti sono realmente efficaci quando utilizzate come indispensabile supporto all’implementazione di sistemi di garanzia della qualità (es. HACCP) e alla verifica della sua efficacia.
Il Regolamento della Commissione Europea sui criteri microbiologici applicabili agli alimenti, (Reg. CE n. 1441/2007) ha recepito l’importanza della sicurezza igienica dei prodotti agroalimentari.
Il laboratorio microbiologico effettua analisi necessarie alla definizione dei parametri microbiologici di un prodotto, di un processo o di un ambiente di lavorazione.
In particolare:
-Ricerca dei microrganismi patogeni su piani lavoro e attrezzature mediante tamponi ambientali;
-Definizione dei parametri indice di contaminazione.
AREA UTENTE 
